Çocuklarda görülen idrar yolu enfeksiyonunun(İYE) erişkin enfeksiyonlarından  önemli farklılıkları mevcuttur. Çocukluklarda İYE genellikle bir doğumsal anomali nedeniyle olur. Bu sebeple İYE ile gelmiş bir çocukta mutlaka araştırma yapmak gereklidir. Erişkin hastalarda olduğu gibi idrar kültürü sonucuna uygun antibiyotik tedavisi verip süreci sonlandırmak yeterli bir tanı ve tedavi süreci sunmayacaktır.